Family alignment for the TNFR domain, displayed in

                     cov    pid  1 [        .         .         .         .         : ] 52
 1 NGFR_HUMAN/3-0 100.0% 100.0%    CA---YGYYQDETT----GRCEACR---VCEA---GSGLVFSCQD-KQNTVC   
 2 NGFR_CHICK/3-0 100.0%  60.5%    CA---YGYFQDELS----GSCKECS---ICEV---GFGLMFPCRD-SQDTVC   
 3 OX40_HUMAN/2-0 100.0%  34.1%    CG---PGFYNDVVSS---KPCKPCT---WCNLRS-GSERKQLCTA-TQDTVC   
 4 OX40_MOUSE/2-0 100.0%  34.1%    CE---TGFYNEAVNY---DTCKQCT---QCNHRS-GSELKQNCTP-TQDTVC   
 5 TNR1_HUMAN/3-0  97.4%  34.1%    CR--KNQYRHYWSENL--FQCFNCS---LCLN----GTVHLSCQE-KQNTVC   
 6 TNR1_MOUSE/3-0  97.4%  24.4%    CK--ENQFQRYLSETH--FQCVDCS---PCFN----GTVTIPCKE-TQNTVC   
 7 OX40_HUMAN/1-3  86.8%  38.5%    CV--GDTYPSN-------DRC--CH---ECRP---GNGMVSRCSR-SQNTVC   
 8 OX40_MOUSE/1-3  86.8%  30.8%    CV--KHTYPSG-------HKC--CR---ECQP---GHGMVSRCDH-TRDTLC   
 9 CD40_BOVIN/1-3  86.8%  28.2%    CG--EKQYPVN-------SLC--CD---LCPP---GQKLVNDCTE-VSKTEC   
10 CD40_MOUSE/1-3  86.8%  33.3%    CS--DKQYLHD-------GQC--CD---LCQP---GSRLTSHCTA-LEKTQC   
11 O00300/1-39    100.0%  25.6%    FP---PKYLHYDEET---SHQLLCD---KCPP---GTYLKQHCTA-KWKTVC   
12 Q92956/1-34     86.8%  25.6%    CK--EDEYPV-G------SEC--CP---KCSP---GYRVKEACGE-LTGTVC   
13 FASA_BOVIN/1-3  86.8%  20.0%    CQ--EGLYREHQ------F-C--CQ---PCPP---GKRKNGDCKRDGDTPEC   
14 FASA_MOUSE/1-3  86.8%  22.5%    CS--EGLYQG-G------PFC--CQ---PCQP---GKKKVEDCKMNGGTPTC   
15 TNRC_HUMAN/1-3  92.1%  26.8%    CRDQEKEYYEPQH-----RIC--CS---RCPP---GTYVSAKCSR-IRDTVC   
16 O35305/1-35     86.8%  30.0%    CT-QERHYEHLG-------RC--CS---RCEP---GKYLSSKCTP-TSDSVC   
17 VT2_MYXVL/1-34  86.8%  30.8%    CR--GNDYEKDG-------LC--CT---SCPP---GSYASRLCGP-GSDTVC   
18 VC22_VARV/1-34  86.8%  28.2%    CK--DTEYKRHN-------LC--CL---SCPP---GTYASRLCDS-KTNTQC   
19 Q92566/1-36     92.1%  20.5%    CK--ENHYRPPGS-----PTCLLCD----CYP---TGSLSRVCDP--EDGQC   
20 TNR2_HUMAN/3-0  97.4%  20.9%    CR--PGWYCALSKQE----GCRLCAPLRKCRP---GFGVARPGTE-TSDVVC   
21 TNR2_MOUSE/3-0  97.4%  25.0%    CE--AGRYCALKTHSG---SCRQCMRLSKCGP---GFGVASSRAP-NGNVLC   
22 CD40_BOVIN/3-0  92.1%  23.8%    CV--EGQHCTSH-------TCESCTPHSLCLP---GFGVKQIATG-LLDTVC   
23 CD40_MOUSE/3-0  92.1%  26.2%    CK--EGQHCTSK-------DCEACAQHTPCIP---GFGVMEMATE-TTDTVC   
24 O35305/2-0      89.5%  28.6%    CT--AGYHWNS--------DCECCRRNTECAP---GFGAQHPLQL-NKDTVC   
25 CD40_BOVIN/2-0  97.4%  16.3%    CG--KGEFLSTWN---REKYCHEHR---YCNPN-LGLRIQSEGTL-NTDTIC   
26 CD40_MOUSE/2-0  97.4%  23.3%    CD--SGEFSAQWN---REIRCHQHR---HCEPN-QGLRVKKEGTA-ESDTVC   
27 O02764/3-0      97.4%  15.0%    CP--QGHFSEGNN-----RACRPWT---NCTL--AGKRTLQPASS-ISDAVC   
28 G2612918/3-0   100.0%  17.1%    CL--AGYFSDAFSS---TDKCRPWT---NCTF--LGKRVEHHGTE-KSDAVC   
29 41BB_HUMAN/2-0  97.4%  17.5%    CC--FGTFNDQKR-----GICRPWT---NCSLD--GKSVLVNGTK-ERDVVC   
30 CD30_HUMAN/3-0 100.0%  28.6%    CR--PGMFCSTSAV----NSCARCFFHSVCPA---GMIVKFPGTA-QKNTVC   
31 Q60846/3-0     100.0%  17.5%    CQ--PGMHCCTPAV----NSCARCK--LHCSG---EEVVKSPGTA-KKDTIC   
32 P97525/3-0      92.1%  20.5%    CQ--PGMYCSTPAV----NSCARCS---EKTV------VKFPDTA-EKNTIC   
33 FASA_BOVIN/3-0  94.7%  25.6%    CK--SNFFCNSSPC----EHCNPCT---TCEH-----GIIEKCTP-TSNTKC   
34 Q63199/3-0      94.7%  22.5%    CK--ENFYCNASLC----DHCYHCT---SCGLE----DILEPCTR-TSNTKC   
35 FASA_MOUSE/3-0  94.7%  28.2%    CK--PDFYCDSPGC----EHCVRCA---SCEH-----GTLEPCTA-TSNTNC   
36 41BB_HUMAN/1-3 100.0%  20.5%    CP--PNSFSSAGGQ----RTCDICR---QCKG---VFRTRKECSS-TSNAEC   
37 41BB_MOUSE/1-3 100.0%  23.1%    CP--PSTFSSIGGQ----PNCNICR---VCAG---YFRFKKFCSS-THNAEC   
38 TNR1_HUMAN/4-0  71.1%  15.4%    CH--AGFFLREN-------ECVSCS---NCKK-------SLECTK-----LC   
39 O00220/2-0     100.0%  22.5%    CK--PGTFRNDNSA----EMCRKCS--TGCPR---GMVKVKDCTP-WSDIEC   
40 O14755/2-0     100.0%  20.5%    CK--EGTFRNVNSP----EMCRKCS---RCPS---GEVQVSNCTS-WDDIQC   
41 G2735725/2-0   100.0%  17.1%    CK--NGTFCLPDHPC---EMCQKCQ--TRCPK---GQVRIAACTQ-QSDLRC   
42 WSL1_HUMAN/1-3  92.1%  26.8%    CDC-AGDFHKKIG-----LFC--CR---GCPA---GHYLKAPCTEPCGNSTC   
43 O00277/1-38     92.1%  22.0%    CDC-AGDFHKKIG-----LFC--CR---GCPA--ASQVALENCSA-VADTRC   
44 TNR2_HUMAN/2-0 100.0%  24.4%    CED--STYTQLWNWV---PECLSCG--SRCSS---DQVETQACTR-EQNRIC   
45 TNR2_MOUSE/2-0 100.0%  26.8%    CEA--SMYTQVWNQF---RTCLSCS--SSCTT---DQVEIRACTK-QQNRVC   
46 VC22_VARV/2-0  100.0%  19.5%    CGS--GTFTSRNNHL---PACLSCN--GRCNS---NQVETRSCNT-THNRIC   
47 G2738033/2-0   100.0%  24.4%    CPD--GTFTSIPNHI---PTCLSCR--GKCSS---NHVETKSCSN-TQDRVC   
48 VT2_MYXVL/2-0  100.0%  22.0%    CKN--ETFTASTNHA---PACVSCR--GRCTG---HLSESQSCDK-TRDRVC   
49 TNR1_HUMAN/2-0 100.0%  26.2%    CES--GSFTASENHL---RHCLSCS---KCRKE-MGQVEISSCTV-DRDTVC   
50 O00220/1-41    100.0%  24.4%    CTE-GVGYTNASNNL---FACLPCT---ACKS---DEEERSPCTT-TRNTAC   
51 O14755/1-41    100.0%  26.8%    CTE-GVDYTNASNNE---PSCFPCT---VCKS---DQKHKSSCTM-TRDTVC   
52 O14720/1-41    100.0%  26.8%    CKY-GQDYSTHWNDL---LFCLRCT---RCDS---GEVELSPCTT-TRNTVC   
53 G2735725/1-40  100.0%  27.5%    CKK--DEYTEYPNDF---PKCLGCR---TCRE---DQVEVSPCNS-TRNTRC   
54 G2738033/1-34   86.8%  28.2%    CNG--TDYNSNN-------LC--CK---QCDP---GMYMTHSCNT-TSNTKC   
55 TNR2_HUMAN/1-3  92.1%  28.2%    CRL--REYYDQTAQ-----MC--CS---KCSP---GQHAKVFCTK-TSDTVC   
56 FASA_BOVIN/2-0 100.0%  23.3%    CSEG-NEYTDKSHHS---DKCIRCS---ICDEEH-GLEVEQNCTR-TRNTKC   
57 Q14292/1-43    100.0%  16.3%    CQEG-KEYTDKAHFS---SKCRRCR---LCDEGH-DVNMESSRNA-HSPATP   
58 CD30_HUMAN/1-3  89.5%  26.8%    CHGNPSHYYDKAV-----RRC--CY---RCPM---GLFPTQQCPQ--RPTDC   
59 P97525/1-37     92.1%  22.5%    CTGD-LSYYPGEAA----RNC--CY---QCPS---GLSPTQPCPQ--GPATA   
60 P97525/2-0      89.5%  22.5%    -VILTTTSNED-------GKCTACV---TCLP---GLVEKAPCSG-NSPRIC   
61 P87599/1-38     97.4%  25.6%    CPN---DYYLEPED----GLCTACV---TCLS---NMVEIQPCGP-DKPRKC   
62 CD30_HUMAN/2-0  94.7%  32.5%    CEP---DYYLDEA-----DRCTACV---TCSRD--DLVEKTPCAW-NSSRVC   
63 TNRC_HUMAN/3-0  97.4%  19.0%    CK--AGHFQNTSSPS---ARC-QPH--TRCEN--QGLVEAAPGTA-QSDTTC   
64 O00300/3-0      92.1%  30.8%    CK--EGRYLEI-------EFCLKHR---SCPP---GFGVVQAGTP-ERNTVC   
65 VA53_VACCC/1-3  92.1%  25.6%    CD--KGEYLDKRH-----NQC--CN---RCPP---GEFAKVRCNG-NDNTKC   
66 TNR1_HUMAN/1-3  94.7%  27.5%    CP--QGKYIHPQNN----SIC--CT---KCHK---GTYLYNDCPGPGQDTDC   
67 CD27_HUMAN/1-3  89.5%  27.5%    CP--ERHYWAQG------KLC--CQ---MCEP---GTFLVKDCDQHRKAAQC   
68 Q92956/2-0     100.0%  23.8%    CP--PGTYIAHLNG---LSKCLQCQ---MCDPA-MGLRASRNCSR-TENAVC   
69 TNRC_HUMAN/2-0  97.4%  27.9%    CA--ENSYNEHWN---YLTICQLCR---PCDPV-MGLEEIAPCTS-KRKTQC   
70 CD27_HUMAN/2-0  97.4%  31.7%    CIP-GVSFSPDHHTR---PHCESCR---HCNS----GLLVRNCTI-TANAEC   
71 NGFR_CHICK/4-0  97.4%  19.5%    CP--EGTFSDEAN---FVDPCLPCT---ICEE---NEVMVKECTA-TSDAEC   
72 O00300/2-0     100.0%  29.3%    CP---DHYYTDSWHTS--DECLYCS--PVCKE---LQYVKQECNR-THNRVC   
73 O24585/1-42     86.8%  20.5%    CK---PANSR---------LCLPCS--TGCPE---GLYESSPCNA-TADRVC   
74 NGFR_CHICK/1-3  84.2%  30.8%    CL--TKMYTTSG-------EC--CK---ACNL---GEGVVQPCGV--NQTVC   
75 NGFR_CHICK/2-0 100.0%  19.5%    CLD-SVTYSDTVSAT---EPCKPCT---QCVG---LHSMSAPCVE-SDDAVC   
76 WSL1_HUMAN/2-0 100.0%  18.6%    CP--QDTFLAWENHHN--SECARCQ---ACDEQ-ASQVALENCSA-VADTRC   
77 Q68396/1-37     94.7%  25.6%    CP--NGTYVSGLY------NCTDCT---QCNV---TQVMIRNCTS-TNNTVC   
78 Q22095/1-36     92.1%  30.8%    CF--DGHYNFR-------GVCFQCT---PCGD---FMYELAKCTD-TSNTVC   
   consensus/100%                  ....................p........p.....................s   
   consensus/90%                   C......a............C..C.....C............ss...tsh.C   
   consensus/80%                   C....tta.t..........C..Cp....C.....s.h..t.ss..tpss.C   
   consensus/70%                   Ct...spa.pt.........C..Cp....C.s...s.hhhp.Cst.ppsshC